教育经历

2017-04至2020-03，东京大学，博士

2010-09至2013-06，吉林大学，硕士

2006-09至2010-06，吉林大学，学士

工作经历

2022-03至今，必威体育，必威官网，副教授

2020-04至2022-03，电子科技大学，基础与前沿研究院，博士后

研究方向

人工智能、计算生物学、生物信息学

主要研究工作集中在开发和利用人工智能方法对于生物学、药学中的多个交叉前沿和热点问题进行探索

基本介绍

张子龙，博士，必威官网副教授，博/硕士生导师，海南省“南海新星”第一批人才计划入选者，海南省D类高层次人才。中国计算机学会(CCF)生物信息学专业委员会委员，中国生物工程学会计算生物学与生物信息学(NCCBB)专业委员会委员，生物信息学与智能信息处理学术会议(BIIP)专业委员会委员，中国国家自然科学基金委(NSFC)函评专家，吴文俊人工智能科学技术奖评审专家。

获得海南省自然科学奖三等奖一项（排名第一），主持国家级自然科学基金面上项目一项、国家级自然科学基金青年项目一项（已结题）、国家级自然科学基金地区项目两项、博士后国际交流引进项目一项（已结题）、主持海南省自然科学基金面上项目一项。以第一或通讯作者在Genome Research、Advanced Science、Research、IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems、Pattern Recognation、AAAI等生物信息学顶级期刊或会议发表论文50余篇。受邀担任Network: Computation in Neural Systems期刊副编辑，Frontiers in Genetics、Machines等SCI期刊客座编辑，担任Nature Biomedical Engineering、Nature Communications等顶级SCI期刊审稿人。

指导本科生发表第一作者SCI或CCF论文：

23级本科生

1. Yilang Li, Yidi Sun, Aoyun Geng, Junlin Xu, Yajie Meng, Feifei Cui, Leyi Wei, Quan Zou, Xiulai Li*, Zilong Zhang*. scHilda: Hierarchical Integration of LLM with KG Database for Single Cell Type Annotation. PLOS Computational Biology 2026, 22(5):e1014291. (中科院大类二区，影响因子3.7，李奕朗同学为2023级本科生)

2. Shanyue Wang, Aoyun Geng, Zhenjie Luo, Yazi Li, Junlin Xu, Yajie Meng, Leyi Wei, Quan Zou, Zilong Zhang*, Tao Wang*, Feifei Cui*. MsgaBpred: A B-cell Epitope Predictor Integrating AlphaFold3-predicted Structures with Multi-scale GCNs and Pre-trained Language Model ESM-C. PLOS Computational Biology 2026, 22(4):e1014195. (中科院大类二区，影响因子3.7，王善月同学为2023级网安公司本科生)

3. Jiaxing Song, Aoyun Geng, Qianmao Wen, Junlin Xu, Yajie Meng, Feifei Cui, Quan Zou, Leyi Wei, Zilong Zhang*. AcidProNet: Acidophilic Protein Classification via DCGAN-GP-Based Data Augmentation and Parameter-Shared Mixture-of-Experts. Journal of Chemical Information and Modeling 2025, 65(24):13145-13162. (TOP期刊，影响因子5.3，宋佳星同学为2023级本科生)

4. Jiajing Wang, Aoyun Geng, Ziyuan Yan, Xiaomeng Lin, Yuanhao Li, Junlin Xu, Yajie Meng, Zilong Zhang, Leyi Wei, Quan Zou, Feifei Cui. FA-Amy: An amyloid protein prediction model based on protein pre-trained large models and an attention-fusion strategy. International Journal of Biological Macromolecules 2026; 335:149267. （TOP期刊、中科院大类二区，王加泾同学为2023级本科生）

5. Ziyuan Yan, Aoyun Geng, Yazi Li, Jiajing Wang, Junlin Xu, Yajie Meng, Leyi Wei, Quan Zou, Zilong Zhang, Feifei Cui. CNNCaps-DBP: Leveraging protein language models with attention-augmented convolution for DNA-binding protein prediction. Neural Networks. 2026, 195:108261. （TOP期刊、中科院大类二区，严子源同学为2023级本科生）

6. Zihang Wang, Aoyun Geng, Junlin Xu, Yajie Meng, Zilong Zhang, Leyi Wei, Quan Zou, and Feifei Cui. A comprehensive review of computational methods for predicting DNA N4-methylcytosine sites. International Journal of Biological Macromolecules, 2025: p. 148221. （TOP期刊、中科院大类二区，王子航同学为2023级本科生）

7.Guanjie Song, Zhenjie Luo, Aoyun Geng, Junlin Xu, Yajie Meng, Feifei Cui, Leyi Wei, Quan Zou, Zilong Zhang*. Protein Solubility Prediction Using Fused Graph Convolutional Networks and Improved Attention Networks with AlphaFold3-Derived Features. Journal of Chemical Information and Modeling 2026, 66(2):894-909. (TOP期刊，影响因子5.3，宋冠颉同学为2023级本科生)

22级本科生

1. Jingwei Lv, Qianyang Wu, Jian Liu, Binlu Yang, Yuanhao Li, Junlin Xu, Yajie Meng, Leyi Wei, Zilong Zhang, Quan Zou, Xiulai Li*, Feifei Cui*. INB³P: A Multi-Modal and Interpretable Co-Attention Framework Integrating Property-Aware Explanations and Memory-Bank Contrastive Fusion for Blood–Brain Barrier Penetrating Peptide Discovery. Advanced Science 13, no. 34 (2026): e23984. https://doi.org/10.1002/advs.202523984 (中科院大类一区，影响因子14.2分，TOP期刊，吕经纬同学为2022级本科生)

2. Jingwei Lv, Aoyun Geng, Zhuoyu Pan, Leyi Wei, Quan Zou, Zilong Zhang, Feifei Cui*. iBitter-GRE: A Novel Stacked Bitter Peptide Predictor with ESM-2 and Multi-View Features. Journal of Molecular Biology 2025, 437(8):169005. (中科院大类二区，吕经纬同学为2022级本科生)

3. Jingwei Lv, Kexin Li, Yike Wang, Junlin Xu, Yajie Meng, Feifei Cui, Leyi Wei, Qingchen Zhang and Zilong Zhang. ACP-EPC: an interpretable deep learning framework for anticancer peptide prediction utilizing pre-trained protein language model and multi-view feature extracting strategy. Molecular Diversity, 2025. (中科院大类二区，吕经纬同学为2022级本科生)

4. Yuanhao Li, Aoyun Geng, Zheyu Zhou, Feifei Cui, Junlin Xu, Yajie Meng, Leyi Wei, Quan Zou, Qingcheng Zhang, Zilong Zhang*. AVP-HNCL: Innovative Contrastive Learning with a Queue-Based Negative Sampling Strategy for Dual-Phase Antiviral Peptide Prediction. Journal of Chemical Information and Modeling 2025. (TOP期刊，李袁昊同学为2022级本科生，生态学专业)

5. Zheyu Zhou, Cuilin Xiao, Jinfen Yin, Hao Duan, Chunling Liu, Feifei Cui, Zilong Zhang*. PSAC-6mA: 6mA Site Identifier Using Self-Attention Capsule Network based on Sequence-Positioning. Computers in Biology and Medicine. (中科院小类一区，TOP期刊，周喆誉同学为2022级本科生)

21级本科生

1. Cuilin Xiao, Zheyu Zhou, Jiayi She, Jinfen Yin, Feifei Cui, Zilong Zhang*. PEL-PVP: Application of plant vacuolar protein discriminator based on PEFT ESM-2 and bilayer LSTM in an unbalanced dataset. International Journal of Biological Macromolecules 2024; 277:134317. (中科院大类一区，影响因子7.7, TOP期刊, 肖萃林同学为2021级本科生，软件工程专业)

2. Yazi Li, Xiaoman Wei, Qinglin Yang, An Xiong, Xingfeng Li, Quan Zou, Feifei Cui*, Zilong Zhang*. msBERT-Promoter: a multi-scale ensemble predictor based on BERT pre-trained model for the two-stage prediction of DNA promoters and their strengths. BMC Biology 2024; 22(1):126. (中科院大类一区，TOP期刊，李亚子同学为2021级本科生，应用数学专业)

3. Ziyi Wang, Aoyun Geng, Hao Duan, Feifei Cui, Quan Zou, Zilong Zhang*. A Comprehensive Review of Approaches for Spatial Domain Recognition of Spatial Transcriptomes. Briefings in Functional Genomics 2024, 23(6):702-712. (王梓懿同学为2021级本科生)

4. Haoye Qiu, Donglai Wang, Xiaoyang Liu, Feifei Cui, Zilong Zhang*. FCLNCM: Feature-Weight and Cluster-Weight Learning in Neutrosophic c-Means Clustering for Biomedical Applications. Neural Networks. (审稿中，裘昊晔同学为2021级本科生)

指导本科生大创项目
基于癌症基因表达数据的自适应加权中智C-均值聚类算法研究（项目负责人：裘昊晔）

基于Diffusion的高穿膜性环肽定向生成模型（项目负责人：周喆誉）

指导本科生竞赛

1. 第二十六届中国机器人及人工智能大赛—全国一等奖。参赛人员：王紫涵、周喆誉、肖萃林。指导老师：张子龙、崔菲菲。

2. 第十届全国老员工统计建模大赛—广东赛区一等奖。参赛人员：李亚子、杨奕帆、和琯。指导老师：张子龙。

3. 2024年中国高校计算机大赛-移动应用创新—海南省级赛二等奖。参赛人员：尹锦芬、周喆誉、肖萃林、佘嘉怡、王紫涵。指导老师：张子龙、崔菲菲。

4. 第17届中国老员工计算机设计大赛—海南省级赛二等奖。参赛人员：佘嘉怡、肖萃林、周喆誉、尹锦芬、王紫涵。指导老师：张子龙。

5. 第十届全国老员工生命科学竞赛（创新创业类）—全国二等奖。参赛人员：周喆誉、颜诗雨、尹锦芬、李亚子、王加泾。指导老师：张子龙。

6. 第十届全国老员工生命科学竞赛（创新创业类）—全国三等奖。参赛人员：佘嘉怡、刘航、邹姗、李袁昊、杨青霖、肖萃林。指导老师：张子龙。

7. 第18届中国老员工计算机设计大赛—海南省级赛二等奖。参赛人员：佘嘉怡、刘航、李袁昊、杨青霖、肖萃林。指导老师：张子龙。

8. 第二十八届中国机器人及人工智能大赛—全国二等奖。参赛人员：刘若菱、郑思琦、王子航。指导老师：张子龙。

9. 第二十八届中国机器人及人工智能大赛—全国二等奖。参赛人员：苏子璐、胡家瑞、严子源。指导老师：张子龙。

10. 第十一届全国老员工生命科学竞赛（创新创业类）—全国二等奖。宋佳星、宋冠颉、林子轩、姚舜禹、王善月、李袁昊。指导老师：张子龙。

11. 第19届中国老员工计算机设计大赛—海南省级赛二等奖。参赛人员：朱怡敏、张哲铭、朱凌杰、张宇、周喆誉、李袁昊。指导老师：张子龙、陈少凡。

12. 2026年中国高校计算机大赛-移动应用创新赛暨海峡两岸创新作品赛—海南省级赛二等奖。参赛人员：朱凌杰、杨钰琳、倪亦菲、宋冠颉、王子航。指导老师：张子龙。

课程教学

算法设计与分析、机器学习、自然语言处理、近代统计方法、图论及其应用、Python语言程序设计基础、人工智能通识

个人主页

http://www.bioai-lab.com/info/zhangzilong

Ø 欢迎本科期间目标发表第一作者SCI或CCF论文（请勿24小时内同时向多位老师群发邮件）；

Ø 欢迎感兴趣报考硕士、博士的同学联系（请勿24小时内同时向多位老师群发邮件），优先考虑具有计算机、统计、数学等相关背景的同学；

Ø 课题组长期招收博士后（年薪32万左右），欢迎邮件咨询；

Ø 与英国剑桥大学、日本东京大学、韩国成均馆大学、沙特阿卜杜拉国王科技大学等国内外科研院校具有良好合作关系，优秀者可推荐前往深造、访学。